Historia Klubu Sportowego „Błękitni” Owińska rozpoczęła się pod koniec sierpnia 1989 roku, kiedy to Radosław Grygiel i Andrzej Gryka wystąpili z inicjatywą założenia sekcji piłkarskiej w Owińskach. 11 listopada 1989 roku odbyło się spotkanie założycielskie z udziałem ówczesnego Naczelnika Gminy Czerwonak, dyrektora Kombinatu Państwowego Gospodarstwa Ogrodniczego w Owińskach, dyrektora Szkoły Podstawowej oraz dwudziestu innych osób. Na przełomie 1989 i 1990 roku dokonano wyboru pierwszych władz klubu, uchwalono statut, podjęto uchwałę o nazwie (początkowo Klub Sportowy Owińska) oraz o barwach, którymi stały się niebieski i biały. Pierwszy oficjalny trening odbył się 13 stycznia 1990 roku, a miesiąc później drużyna wzbogaciła się o pierwszy sprzęt sportowy, ufundowany przez Andrzeja Grykę. 1 kwietnia 1990 roku przyjęto oficjalną nazwę: Klub Sportowy „Błękitni” Owińska. Pierwszym trenerem został Zbigniew Promiński. 8 kwietnia 1990 roku rozegrano pierwszy mecz z wychowankami Państwowego Młodzieżowego Ośrodka Wychowawczego w Owińskach, zakończony zwycięstwem „Błękitnych” 9:5. Debiutancki mecz wyjazdowy odbył się w Uzarzewie, gdzie miejscowy LZS pokonał „Błękitnych” aż 10:3.
19 sierpnia 1990 roku w pierwszym oficjalnym meczu w ramach Pucharu Polski „Błękitni” przegrali u siebie z LKS Kicin 1:2. Obie bramki dla drużyny z Kicina strzelił Zenon Kijanowski, który wkrótce przeszedł do „Błękitnych”. Do dzisiejszego dnia razem ze swoim synem Rafałem, który grał w „Błękitnych” w latach 2000-2012 są uznawani za najlepszych piłkarzy w historii klubu. 27 sierpnia 1990 roku nowym trenerem został Andrzej Gajewski. 9 września 1990 roku rozegrany został pierwszy ligowy mecz w klasie C z MKS OBRA II MOSINA, zakończony wynikiem 3:3. W 2005 roku drużyna seniorów awansowała do klasy A. Rok później świętowano awans do klasy okręgowej, jednak po jednym sezonie nastąpił spadek.
W latach 2005 – 2012 klub rozwijał się najprężniej, a na trybunach podczas niedzielnych meczów seniorów zasiadało nawet 300 widzów głośno dopingujących swoich piłkarzy. W roku 2008 klub zmienił oficjalną nazwę na Gminny Klub Sportowy „Błękitni” Owińska, a rok później ponownie wywalczył awans do klasy okręgowej. W roku 2011 zespół seniorów awansował do IV ligi, jednak problemy organizacyjne i finansowe spowodowały, że w 2012 roku pierwsza drużyna seniorów została wycofana z rozgrywek (mimo to na zakończenie sezonu zespół zajął drugie miejsce w rozgrywkach). Skupiono się wówczas na pracy z młodzieżą w ramach Akademii Piłkarskiej „Błękitni” Owińska. W latach 2010-2012 w klubie z Owińsk funkcjonowały 2 drużyny seniorskie oraz 10 zespołów młodzieżowych. Łącznie w zajęciach treningowych i rozgrywkach uczestniczyło w tym czasie ok. 350 zawodników.
W 2022 roku priorytetem nadal pozostaje praca z dziećmi i młodzieżą. Klub zrzesza obecnie około 300 zawodników, w ponad 95% mieszkańców Gminy Czerwonak. Zespół seniorów uczestniczy w rozgrywkach na poziomie klasy A z realnymi szansami na awans do klasy okręgowej. Obiekty piłkarskie w Owińskach stanowią własność Gminy Czerwonak i są zarządzane przez Centrum Rozwoju Kultury Fizycznej AKWEN w Czerwonaku.
Prezesi AP Błękitni Owińska
1989-2007 - Stanisław Szcześniak
2007-2011 - Marcin Wojtkowiak
2011-2013 - Tomasz Pieńczak
2013-2017 - Dariusz Kasztelan
2017-2019 - Rafał Rogoziecki
2019-2021 - Damian Paprzycki
2021-obecnie - Arkadiusz Klein
Trenerzy drużyn seniorskich AP Błękitni Owińska
Zbigniew Promiński, Andrzej Gajewski, Andrzej Kijanowski, Krzysztof Nader (dwukrotnie), Aleksander Kononiuk, Ryszard Święcichowski, Zenon Kijanowski, Przemysław Napierała, Maciej Gutowski, Tadeusz Łuczak (w latach 90-tych był trenerem pierwszoligowej Warty Poznań), Jacek Pasek, Bogdan Sękowski, Wiktor Weber i Łukasz Bandosz.